清华王宏伟教授Nature子刊揭示RNA干扰通路中Dicer蛋白结构机制

2013年4月28日，Nature子刊Nature Structural and Molecular Biology在线发表了清华大学生命科学学院王宏伟教授的研究论文，报道了在RNA干扰（RNAi）通路中人源Dicer蛋白加工小RNA的活性受RNA前体自身结构及相关蛋白质因子调节的结构机制。

RNA干扰及相关的RNA介导的基因沉默通路是真核生物细胞中的重要基因调控机制之一。在该基因调控通路中，装载在RNA沉默诱导复合体中的小RNA分子（包括siRNA和miRNA）通过与标靶信使RNA的序列匹配来特异性地抑制信使RNA的翻译，从而导致基因表达沉默。小RNA分子是由细胞核内或者外源的较长的双链RNA被特异性的RNA酶Dicer蛋白切割后所生成。在人体内只有一种Dicer蛋白，它同时负责对siRNA和miRNA的加工。已有的研究表明，人源Dicer对miRNA前体的加工效率远远大于对siRNA前体的加工。理解该现象的机理对于深入认识RNAi的调控机制及设计更有效的RNAi前体分子具有重要意义。但是到目前为止，尚无任何对该过程分子机制的解释。

利用电子显微学和单颗粒计算机三维重构技术，王宏伟及其合作者们获得了人源Dicer蛋白及其与多种小RNA前体复合体的冷冻电子显微镜结构，发现了siRNA前体及miRNA前体的不同结构导致它们诱导人源Dicer产生不同的构象变化，从而导致前者难以接近而后者很容易到达Dicer的酶活位点。这个发现为人源Dicer切割不同RNA底物活性的差异提出了分子机制上的解释。更进一步，该论文还发现调节小RNA生成的蛋白质TRBP及PACT都诱导Dicer的构象变化，使其适于切割小RNA前体，从而促进小RNA的生成。