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五种不同的制备siRNA方法的比较

发布时间: 2015-12-16  点击次数: 1192次

比较项目化学合成体外转录RNAse III降解dsRNAsirna
表达载体PCR
表达框材料需求 21-mer RNA
oligos(一对)29-mer DNA oligos(一对)转录模版 (200-1000bp,两侧带T7 启动子)55-60-mer DNA oligos(一对) ~50-mer DNA oligos(一对)全部制备/合成时间所需时间4天—2周24 小时 + DNA oligo合成时间1 天 + 转录模版制备时间5天以上 + DNA oligo合成时间~ 6 小时 + DNA oligo合成时间个人所需操作时间几乎不需要*中等中等多中等是否需要验证和寻找zui有效siRNA需要需要不需要需要需要能否标记siRNA (例如用于荧光显微镜分析siRNA进入细胞过程或者在细胞中的定位)能能能不能不能转染的相对难易程度好好好差差可筛选性 (例如抗生素筛选) 不可以不可以不可以可以不可以能否用于长效抑制不可以不可以不可以可以(抗生素筛选)不可以能否大规模制备可以有限有限可以有限检测总体转染效率不可以不可以不可以可以不可以每个基因的相对费用(不包含人力)高中等低中等中等*取决于合成后是否包含纯化、去保护,以及厂家提供的是已经退火的即用型双链还是冻干的单链